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Avances del pangenoma humano y su impacto en la medicina moderna

Avances del pangenoma humano y su impacto en la medicina moderna

Guillermina Alonso Gómez

Doctora en Biología Molecular por la Universidad Central de Venezuela

Sara Carmona Gallardo

Graduada en Biotecnología por la Universidad de Extremadura, BIOTECH MEDICAL SIMULATION S.L., info@biotme.com.

Resumen 

La investigación científica a nivel mundial avanza a pasos agigantados, y una de las áreas más fascinantes hoy en día está representada por el estudio del pangenoma humano. Este concepto revolucionario ha abierto nuevas puertas en nuestra comprensión de la genética humana y su relevancia en la práctica clínica.  

En la vanguardia de la genética molecular: el Proyecto Genoma Humano y el Proyecto Pangenoma Humano 

La genética molecular ha trascendido las fronteras de la ciencia hacia un territorio que roza lo asombroso. En este recorrido por la biología del siglo XXI, dos proyectos destacan como faros guía en nuestro viaje hacia la comprensión total del genoma humano: El Proyecto Genoma Humano y el Proyecto Pangenoma Humano. Son esfuerzos titánicos que están redefiniendo lo que sabemos sobre nuestra propia naturaleza, arrojando luz sobre la complejidad inherente a nuestra existencia, y desafiando los límites de la medicina personalizada. 

Estos dos proyectos revolucionarios han capturado la atención y la imaginación de científicos, de médicos y del público en general. 

¿Qué es el Proyecto Genoma Humano?  

El Proyecto Genoma Humano es una iniciativa científica global, un esfuerzo colaborativo sin precedentes que involucró a científicos de todo el mundo, y requirió avances tecnológicos significativos en el campo de la secuenciación del ADN.  El Proyecto comenzó en la década de 1990 y se completó en el año 2003, y tuvo como objetivo principal secuenciar y mapear todos los genes presentes en el genoma humano.   

El Proyecto Genoma Humano representó una empresa monumental, que trazó un mapa de las 3 mil millones de letras del ADN humano. De manera comparativa, se puede imaginar el genoma como un inmenso paisaje de letras químicas, las cuales codifican las instrucciones para construir y mantener a un ser humano de manera completa. El Proyecto Genoma Humano se propuso hacer la cartografía de todo el inmenso paisaje, revelando los contornos de nuestros genes, identificando las áreas y conexiones de interés, y proporcionando una hoja de ruta invaluable para la investigación médica.  Se logró obtener el mapa detallado de la composición genética de nuestra especie.  

El resultado final del proyecto fue la identificación de aproximadamente 20000 a 25000 genes en el genoma humano, así como la secuencia de 3 mil millones de pares de bases que componen nuestro ADN. 

Pero rápidamente, los investigadores se dieron cuenta que se tenía que dar un giro a esta investigación. Se partió del principio de que el Proyecto Genoma Humano revelaría un «genoma de referencia», una especie de modelo estándar para la humanidad. Sin embargo, la realidad demostró ser mucho más intrincada. La situación es que si bien los humanos compartimos un núcleo común de genes, las variaciones genéticas individuales son vastas y complejas. Estas diferencias son cruciales en la predisposición a enfermedades, la respuesta a los medicamentos y una variedad de rasgos físicos y de comportamiento. 

Figura 1. Logo del Proyecto Genoma Humano. 

El antes y el después del Proyecto Genoma Humano 

El 25 de abril de 1953 marcó un hito monumental en la historia de la genética, con Watson y Crick revelando en la prestigiosa revista Nature, las características fundamentales de la estructura del ADN. Ahora, tras casi 71 años de avances y descubrimientos, nos asombramos del camino recorrido desde ese momento histórico. 

Veintitrés años atrás, el 15 de febrero de 2001, bajo la dirección de Watson, se presentó un primer esbozo del genoma humano en la misma revista Nature, gracias al esfuerzo colaborativo del Consorcio Internacional para la Secuenciación del Genoma Humano. Este hito coincidió con la publicación en la revista Science de otro esbozo por parte de la empresa Celera Genomics, liderado por Craig Venter. Sin embargo, ambos borradores inicialmente presentaban lagunas y áreas de incertidumbre. 

A medida que avanzaba esa década, en el año 2004, se anunció la finalización del primer ensamblaje del genoma humano, a pesar de cubrir solo el 96% de la eucromatina. Desde entonces, gracias al continuo progreso en tecnología de secuenciación y bioinformática, el genoma humano ha sido objeto de mejoras y refinamientos constantes. La versión actual, revisada por última vez en el año 2019, representa un logro significativo en nuestra comprensión de la complejidad genética humana. 

Sin embargo, la secuenciación del genoma no es suficiente por sí sola; era esencial comprender su contenido con la mayor resolución posible. Desde el primer borrador en el 2001, los científicos se han sorprendido por diversos hallazgos: 

– La estimación inicial de 30000 a 40000 genes reveló similitudes con genes de otros vertebrados e incluso con los genes de bacterias. 

– La mitad del genoma humano proviene de transposones, elementos móviles que desempeñan un papel clave en la evolución genética. 

– Se identificaron 1,4 millones de polimorfismos, variaciones genéticas que contribuyen a la diversidad entre individuos. 

– La presencia de una cantidad considerable de pseudogenes y ARN no codificantes planteó interrogantes sobre su función y relevancia. 

La culminación del primer ensamblaje reveló que solamente menos del 2% de nuestro genoma codifica proteínas, una cifra significativamente menor de lo que se esperaba en el siglo XX. Además, el número estimado de genes codificantes se redujo a solo 20000, desafiando las suposiciones previas. 

En resumen, el viaje desde la revelación inicial de la estructura del ADN hasta la secuenciación y comprensión del genoma humano ha sido un proceso fascinante, lleno de descubrimientos sorprendentes y desafíos científicos continuos. 

¿Qué es el Proyecto Pangenoma Humano?  

Aunque el Proyecto Genoma Humano fue un logro monumental, también reveló que el genoma humano es mucho más complejo y diverso de lo que se pensaba inicialmente. En lugar de ser un conjunto estático de genes idénticos en todos los individuos, se descubrió que el genoma humano exhibe una amplia variabilidad genética entre las poblaciones y los individuos. 

Aquí es donde entra en escena el Proyecto Pangenoma Humano, que nace como una respuesta a esta diversidad genética, y representa una iniciativa científica de vanguardia. Si el Proyecto Genoma Humano nos dio una imagen estática del genoma humano, el Proyecto Pangenoma  busca capturar la dinámica y la diversidad de las secuencias genéticas. Y así surgió este proyecto internacional, conocido como el Consorcio de Referencia del Pangenoma Humano, el cual se inició en el año 2019 con el objetivo de cartografiar la totalidad de la variación genética humana. 

En lugar de representar un solo genoma de referencia, el pangenoma reconoce la existencia de un conjunto de genes que varían entre las personas y que pueden influir en una amplia gama de características y condiciones humanas. En lugar de centrarse en el genoma de referencia, el Proyecto Pangenoma Humano está mapeando miles de genomas individuales, desde diferentes grupos étnicos hasta personas con afecciones médicas específicas. 

En otras palabras, el pangenoma humano abarca no solo los genes presentes en el genoma de referencia, sino también las variantes genéticas adicionales que pueden estar ausentes en ciertas poblaciones o individuos, así como las secuencias de ADN que pueden variar en tamaño y composición entre las personas. 

Este enfoque nos permite explorar la inmensa variedad de la humanidad y comprender cómo las variaciones genéticas contribuyen a nuestra salud.  Por ejemplo, ciertas variantes genéticas pueden predisponer a ciertas poblaciones a enfermedades específicas, mientras que otras variantes genéticas pueden conferir resistencia a enfermedades que si afectan a otras poblaciones. Al comprender estas diferencias, podemos desarrollar tratamientos médicos más precisos y personalizados, adaptados a la diversidad genética de cada individuo. 

En el mes de mayo del año 2023 se publicó un primer borrador del pangenoma humano, a partir de la secuencia del genoma de 47 individuos genéticamente diversos, con una precisión superior al 99%.  El Consorcio de Referencia del Pangenoma Humano estima tener la secuencia del genoma de 350 individuos para mediados del año 2024.  

Aplicación en el campo de la medicina humana 

El conocimiento del pangenoma humano tiene importantes implicaciones en el campo de la medicina humana, y sus resultados están transformando la forma en que entendemos y abordamos una amplia gama de condiciones y enfermedades. El pangenoma humano incorpora variaciones genéticas adicionales, incluyendo secuencias de ADN que no están presentes en el genoma de referencia. Esto nos brinda una visión más completa de la diversidad genética humana, y nos ayuda a entender mejor las diferencias individuales en la susceptibilidad a enfermedades, la respuesta a los tratamientos, y otros aspectos de la salud. 

Este conjunto de nuevos conocimientos tiene el potencial de transformar la enseñanza en medicina de varias maneras significativas.  

Algunas de las aplicaciones más destacadas incluyen: 

  1. Medicina personalizada: el conocimiento del pangenoma humano permite a los médicos y científicos comprender mejor cómo las variaciones genéticas individuales pueden influir en la respuesta de un paciente a ciertos medicamentos y tratamientos. Esto facilita la implementación de enfoques de medicina personalizada, donde los tratamientos no se enfocan hacia la enfermedad, sino que se adaptan específicamente a las características genéticas de cada individuo, con un evidente potencial de mejorar la eficacia de los tratamientos y reducir los efectos secundarios adversos, beneficiando tanto a los pacientes como a los profesionales de la salud.

Al comprender mejor las variaciones genéticas entre individuos, los médicos pueden además personalizar las intervenciones clínicas para adaptarse a las necesidades específicas de cada paciente. Esto significa que ahora los estudiantes de medicina deben también estar familiarizados con las últimas investigaciones en pangenoma, para proporcionar atención médica óptima en un mundo cada vez más centrado en el paciente. 

  1. Diagnóstico y prevención de enfermedades: la identificación de variantes genéticas específicas asociadas con ciertas enfermedades permite un diagnóstico más preciso y temprano de condiciones médicas, así como la implementación de estrategias de prevención dirigidas a individuos con un mayor riesgo genético. Esto resalta la importancia de integrar la genómica y el pangenoma en el plan de estudios, preparando a los futuros médicos para abordar los desafíos de la medicina preventiva y diagnóstica.
  2. Investigación biomédica: el estudio del pangenoma humano proporciona información invaluable para la investigación biomédica, permitiendo a los científicos identificar nuevos genes y las variantes genéticas asociadas con enfermedades, con diferentes condiciones humanas y las posibles nuevas terapias. Esto abre nuevas vías para el desarrollo de tratamientos más efectivos.
  3. Genética de poblaciones: el análisis del pangenoma humano también arroja luz sobre la diversidad genética entre diferentes poblaciones humanas, lo que ayuda a comprender mejor la evolución humana y las diferencias genéticas que pueden influir en la salud y el bienestar de las poblaciones en todo el mundo.
  4. Nueva era de la medicina genómica: desde el año 2013, y a raíz de los conocimientos obtenidos con el Proyecto Genoma Humano, se conoce una lista de genes asociados a enfermedades genéticas, la cual se actualiza constantemente. En la actualidad cuenta con 83 genes, y cerca del 4% de la población mundial puede ser portadora de mutaciones en estos genes. En esta nueva era, la medicina debe ser más preventiva y predictiva utilizando esta información ya disponible, y no esperar el diagnóstico.  

 

La integración del pangenoma humano en la enseñanza médica proporciona a los estudiantes una base sólida en genética y genómica, equipándolos con las habilidades y el conocimiento necesarios para abordar los desafíos médicos del siglo XXI.  

Desafíos y oportunidades: hacia una medicina personalizada 

Por supuesto, enfrentamos desafíos significativos en este viaje hacia la medicina personalizada basada en el genoma. La enorme cantidad de datos generados por el Proyecto Pangenoma Humano plantea preguntas éticas sobre la privacidad y el acceso equitativo a la atención médica. Además, la interpretación de esta vasta cantidad de información genética es un desafío en sí mismo, requiriendo avances en inteligencia artificial y bioinformática. 

Sin embargo, las oportunidades son igualmente emocionantes. La medicina personalizada basada en el genoma tiene el potencial de revolucionar el tratamiento de enfermedades, permitiendo diagnósticos más precisos, terapias más efectivas y una prevención más proactiva. Además, al comprender mejor la base genética de los rasgos humanos, podemos explorar nuevos horizontes en la biología evolutiva y la comprensión de lo que significa ser humano. 

Relación entre el pangenoma humano y los simuladores de enseñanza médica 

¿Existe una relación entre el estudio del pangenoma humano y el uso de simuladores de enseñanza médica? Aunque puede no ser evidente de manera inmediata, sí que hay una conexión importante entre estas dos áreas: 

  1. Contextualización clínica: los simuladores de enseñanza médica ofrecen a los estudiantes la oportunidad de poner en práctica sus conocimientos en un entorno clínico simulado. Cuando se integra el estudio del pangenoma humano en estos escenarios se permite a los estudiantes comprender cómo las variaciones genéticas pueden influir en la práctica clínica, los diagnósticos tempranos  y las decisiones de tratamiento.
  2. Enfoque en la personalización: al utilizar simuladores de enseñanza médica que incorporan casos clínicos basados en el pangenoma humano, los estudiantes pueden aprender a aplicar enfoques de tratamiento personalizado, que tienen en cuenta las diferencias genéticas individuales. Esto los prepara para enfrentar los desafíos de la medicina personalizada en su práctica futura.
  3. Actualización continua: los simuladores de enseñanza médica pueden actualizarse regularmente para reflejar los avances en el estudio del pangenoma humano y la genómica médica. Esto garantiza que los estudiantes estén al tanto de los últimos desarrollos en la investigación genética y puedan aplicar este conocimiento en su práctica clínica.

En el umbral de una nueva era genómica 

En resumen, ambos proyectos relacionados con el genoma humano representan hitos monumentales en nuestro viaje hacia la comprensión del código genético humano, y aunque están intrínsecamente relacionados, representan diferentes etapas en nuestra comprensión de la genética humana. Si el Proyecto Genoma nos proporcionó un mapa inicial, el Proyecto Pangenoma está expandiendo los horizontes, revelando la diversidad y la complejidad de la humanidad en toda su gloria genética. 

El concepto de pangenoma humano reconoce que cada individuo posee un conjunto único de genes y variantes genéticas, las cuales pueden influir en una amplia gama de características y susceptibilidades a enfermedades. Esto contrasta con la visión tradicional de un genoma humano estático y uniforme, y destaca la importancia de comprender y explorar la diversidad genética en la población humana. 

A medida que avanzamos en esta nueva era genómica, es esencial recordar que cada letra en nuestro ADN cuenta una historia única, una historia que nos conecta a todos como miembros de una sola especie, pero también nos recuerda nuestra individualidad y diversidad. En última instancia, puede ser que en la comprensión de estos contenidos genéticos sea donde encontramos las respuestas a algunos de los misterios de la historia humana, y las claves para un futuro más saludable y prometedor. 

En conclusión, los aportes del conocimiento del pangenoma humano sobre la diversidad genética intrínseca de nuestra especie, tiene importantes implicaciones en el diagnóstico, tratamiento e investigación de una amplia gama de condiciones y enfermedades humanas. Estos avances están transformando la medicina y allanando el camino para un enfoque más personalizado y preciso de la atención médica en el futuro. 

Te animamos también a explorar más sobre las innovaciones en nuestros simuladores anatómicos que se encuentran a la vanguardia de la simulación médica. Contáctanos a través de nuestra web https://biotme.com/ si quieres mas información, o síguenos a través de nuestras redes sociales.  

Referencias 

Claros, M. G. (2022). Del genoma humano a su pangenoma pasando por los consorcios ENCODE y T2T. Encuentros En La Biología, 15(182), 23–33. https://doi.org/10.24310/enbio.v15i182.17114  

Human Pangenome Reference Consortium. https://humanpangenome.org/ (último acceso: marzo 2024). 

Liao, WW., Asri, M., Ebler, J. et al. A draft human pangenome reference. Nature 617, 312–324 (2023). https://doi.org/10.1038/s41586-023-05896-x   

Wang, T., Antonacci-Fulton, L., Howe, K. et al. The Human Pangenome Project: a global resource to map genomic diversity. Nature 604, 437–446 (2022). https://doi.org/10.1038/s41586-022-04601-8  

Figura 1. Logo del Proyecto Genoma Humano. U.S. Department of Energy, Human Genome Project. Imagen de dominio público. 

 

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